真空冷凍干燥機的加熱系統由電熱管，媒體（硅油）、媒體泵、媒體箱等組成一個循環管路，硅油經電熱管加熱后，由媒體泵輸送至干箱板中的媒體導管，對制品進行加溫，提供升華熱，當凍結時，則由冷卻排管對硅油進行降溫，由媒粉碎機體泵輸送至擱板中間的媒體導管，對制品進行冷卻及凍結。
干燥能排除95％～99％以上的水分，使干燥后產品能長期保存而不致變質。因物料處于凍結狀態，溫度很低，所以供熱的熱源溫度要求不高，采用常溫或溫度不高的加熱器即可滿足要求。如果冷凍室和干燥室分開時，干燥室不需絕熱，不會有很多的熱損失，故熱能的利用很經濟。
干燥后的產品與干燥前相比，在性狀上有很大的差別。凍干法則基本上在0℃以下進行，即在產品凍結的狀態下進行，解析干燥的時候一般不超過60℃。
有用戶問我，能不能用物料溫度來判定凍干終結時間？這是不可以的，一般是需要根據經驗確定合適的凍干時間的，物料溫度只代表探頭傳感器溫度，可能與實際情況有誤差。
但是材料的溫度可以作為輔助判斷條件。畢竟只有當材料中水的升華速度不足以抵消環境溫度的升高時，材料的溫度才會開始緩慢上升。另外要說明的是，不同數量單位的物料，也有不同的凍干時間，在這種情況下經驗可能更有用。